Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms