Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM171Q8WVE6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM171Q8WVE6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms