Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM41Q8WV44 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM41Q8WV44 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM41Q8WV44 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms