Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms