Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3RF3Q8TEJ3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms