Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms