Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-3Q8TAU0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms