Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
COL22A1Q8NFW1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL22A1Q8NFW1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms