Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
VWDEQ8N2E2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VWDEQ8N2E2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms