Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOT1Q8IXI2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms