Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX29P2Q8IUI4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX29P2Q8IUI4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms