Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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