Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF554Q86TJ5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms