Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PKD1L3Q7Z443 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKD1L3Q7Z443 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms