Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMC4Q7Z404 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms