Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
KRT28Q7Z3Y7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms