Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC80Q76M96 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms