Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAM43BQ6ZT52 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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