Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC9Q6ZRR7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms