Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO4C1Q6ZQN7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO4C1Q6ZQN7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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