Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C12orf54Q6X4T0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms