Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOA5Q6Q788 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms