Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRT80Q6KB66 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms