Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATL3Q6DD88 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATL3Q6DD88 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms