Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q5VSD8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q5VSD8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q5VSD8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q5VSD8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q5VSD8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q5VSD8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q5VSD8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q5VSD8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q5VSD8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q5VSD8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q5VSD8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q5VSD8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q5VSD8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q5VSD8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q5VSD8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q5VSD8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q5VSD8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q5VSD8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms