Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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C10orf55Q5SWW7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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C10orf55Q5SWW7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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C10orf55Q5SWW7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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C10orf55Q5SWW7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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C10orf55Q5SWW7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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C10orf55Q5SWW7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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C10orf55Q5SWW7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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C10orf55Q5SWW7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C10orf55Q5SWW7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C10orf55Q5SWW7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C10orf55Q5SWW7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C10orf55Q5SWW7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C10orf55Q5SWW7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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