Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LACTB2Q53H82 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
LACTB2Q53H82 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LACTB2Q53H82 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LACTB2Q53H82 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LACTB2Q53H82 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
LACTB2Q53H82 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LACTB2Q53H82 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms