Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKDCCQ504Y2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKDCCQ504Y2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms