Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC4A8Q2Y0W8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A8Q2Y0W8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A8Q2Y0W8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A8Q2Y0W8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A8Q2Y0W8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A8Q2Y0W8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A8Q2Y0W8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A8Q2Y0W8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A8Q2Y0W8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A8Q2Y0W8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A8Q2Y0W8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A8Q2Y0W8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A8Q2Y0W8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A8Q2Y0W8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A8Q2Y0W8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A8Q2Y0W8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC4A8Q2Y0W8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A8Q2Y0W8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC4A8Q2Y0W8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms