Protein–RNA interactions for Protein: Q1A5X7

WHAMMP3, Putative WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3Q1A5X7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WHAMMP3Q1A5X7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
WHAMMP3Q1A5X7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
WHAMMP3Q1A5X7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
WHAMMP3Q1A5X7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
WHAMMP3Q1A5X7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
WHAMMP3Q1A5X7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
WHAMMP3Q1A5X7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
WHAMMP3Q1A5X7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
WHAMMP3Q1A5X7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
WHAMMP3Q1A5X7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
WHAMMP3Q1A5X7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
WHAMMP3Q1A5X7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms