Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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PTPRNQ16849 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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PTPRNQ16849 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRNQ16849 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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PTPRNQ16849 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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