Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PDK4Q16654 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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