Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms