Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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