Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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SNCBQ16143 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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SNCBQ16143 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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SNCBQ16143 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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SNCBQ16143 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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SNCBQ16143 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNCBQ16143 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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SNCBQ16143 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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SNCBQ16143 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SNCBQ16143 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SNCBQ16143 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SNCBQ16143 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SNCBQ16143 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SNCBQ16143 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SNCBQ16143 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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SNCBQ16143 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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