Protein–RNA interactions for Protein: Q15714

TSC22D1, TSC22 domain family protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1Q15714 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSC22D1Q15714 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms