Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF11Q15544 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms