Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms