Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3CQ15386 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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