Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 NDST2-202ENST00000309979 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.862e-8■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 SLC3A2-219ENST00000542793 539 ntTSL 28.8□□□□□ -14e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.144e-9■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.314e-9■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 GSTA4-206ENST00000486559 1698 ntTSL 23.56□□□□□ -1.844e-7■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 DOT1L-203ENST00000452696 624 ntTSL 316.47■□□□□ 0.235e-6■■■□□ 14.9
PCBP1Q15365 ATXN2L-224ENST00000569318 559 ntTSL 517.68■□□□□ 0.427e-10■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.142e-10■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 HIST1H2AC-201ENST00000314088 1668 ntTSL 1 (best)18.28■□□□□ 0.524e-7■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.484e-7■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.374e-7■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.141e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.111e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 AKT2-218ENST00000483166 4454 ntTSL 213.03□□□□□ -0.321e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 AKT2-216ENST00000476266 3309 ntTSL 512.15□□□□□ -0.461e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 POM121C-203ENST00000473168 549 ntTSL 416.11■□□□□ 0.175e-8■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.045e-8■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 POM121C-204ENST00000473609 563 ntTSL 38.61□□□□□ -1.035e-8■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 SLC16A3-216ENST00000583025 955 ntTSL 221.39■■□□□ 1.011e-8■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 C2-202ENST00000383177 1847 ntTSL 515.77■□□□□ 0.112e-9■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.152e-9■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.32e-9■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 AL645922.1-202ENST00000477310 3377 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.632e-9■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 AL645922.1-201ENST00000456570 3874 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.792e-9■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 C2-201ENST00000299367 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.912e-9■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.081e-7■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.981e-7■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.689e-7■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.589e-7■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 PYCR1-213ENST00000584848 949 ntTSL 516.49■□□□□ 0.239e-7■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 PDLIM1-202ENST00000477757 850 ntTSL 222.6■■□□□ 1.218e-8■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.458e-8■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 IREB2-210ENST00000560840 558 ntTSL 510.88□□□□□ -0.678e-8■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 IREB2-208ENST00000560440 4396 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.848e-8■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 IREB2-202ENST00000558525 865 ntTSL 58.91□□□□□ -0.988e-8■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 IREB2-205ENST00000559215 572 ntTSL 46.7□□□□□ -1.348e-8■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 IREB2-203ENST00000558570 2917 ntTSL 1 (best)6.03□□□□□ -1.448e-8■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.528e-8■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 TMC6-210ENST00000588792 843 ntTSL 220.18■□□□□ 0.821e-7■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 TMC6-205ENST00000586126 821 ntTSL 318.43■□□□□ 0.541e-7■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 TMC6-223ENST00000592594 551 ntTSL 418■□□□□ 0.471e-7■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.355e-7■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 PHF19-214ENST00000616568 4159 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.775e-7■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.357e-8■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.287e-8■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.457e-8■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.517e-8■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.747e-8■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.524e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 CXXC5-209ENST00000507139 472 ntTSL 424.23■■□□□ 1.474e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 LIN54-208ENST00000509748 729 ntTSL 523.58■■□□□ 1.374e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 CXXC5-206ENST00000504844 777 ntTSL 223.49■■□□□ 1.354e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 STXBP2-209ENST00000595861 430 ntTSL 222.05■■□□□ 1.124e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 CXXC5-203ENST00000502336 581 ntTSL 421.88■■□□□ 1.094e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 ACTG1-204ENST00000571721 813 ntTSL 520.89■□□□□ 0.934e-27■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 USP10-205ENST00000562743 888 ntTSL 220.41■□□□□ 0.864e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 USP10-210ENST00000563892 570 ntTSL 319.73■□□□□ 0.754e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.724e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.724e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 ACTG1-209ENST00000575659 742 ntTSL 318.94■□□□□ 0.624e-27■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 ANKRD30BL-204ENST00000470729 1425 ntTSL 1 (best)18.93■□□□□ 0.624e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.624e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 NPEPPS-220ENST00000533573 559 ntTSL 418.65■□□□□ 0.584e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 CXXC5-205ENST00000503511 506 ntTSL 218.43■□□□□ 0.544e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 CXXC5-210ENST00000509238 542 ntTSL 218.43■□□□□ 0.544e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 CXXC5-214ENST00000512816 558 ntTSL 318.43■□□□□ 0.544e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 CXXC5-202ENST00000502295 503 ntTSL 418.21■□□□□ 0.514e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 CXXC5-212ENST00000511457 810 ntTSL 318.21■□□□□ 0.514e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.414e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 CXXC5-216ENST00000520967 878 ntTSL 317.51■□□□□ 0.394e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 CXXC5-204ENST00000502716 900 ntTSL 217.24■□□□□ 0.354e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 STXBP2-206ENST00000594221 747 ntTSL 317■□□□□ 0.314e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.234e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 LAMTOR1-203ENST00000535872 899 ntTSL 515.91■□□□□ 0.144e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 CXXC5-207ENST00000504944 568 ntTSL 315.81■□□□□ 0.124e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.064e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 NPEPPS-218ENST00000532729 711 ntTSL 315.3■□□□□ 0.044e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 NPEPPS-207ENST00000526247 678 ntTSL 315.12■□□□□ 0.014e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 ZC3H4-205ENST00000601973 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.1■□□□□ 0.014e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 ACTG1-203ENST00000571691 761 ntTSL 314.71□□□□□ -0.054e-27■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.064e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 ACTG1-202ENST00000570382 471 ntTSL 414.52□□□□□ -0.094e-27■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.124e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 NPEPPS-202ENST00000525007 649 ntTSL 314.29□□□□□ -0.124e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 ACTG1-211ENST00000575994 856 ntTSL 314.29□□□□□ -0.124e-27■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC13.81□□□□□ -0.24e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 COPZ1-207ENST00000549116 736 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.214e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.234e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 NPEPPS-213ENST00000528751 558 ntTSL 413.56□□□□□ -0.244e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.244e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.254e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 LIN54-210ENST00000510877 4507 ntTSL 1 (best)13.46□□□□□ -0.254e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 USP10-207ENST00000563048 1315 ntTSL 213.19□□□□□ -0.34e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 LAS1L-205ENST00000484069 5205 ntTSL 213.17□□□□□ -0.34e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.314e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 LAS1L-203ENST00000374811 2439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.334e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 LIN54-206ENST00000506560 2757 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.364e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 USP10-202ENST00000540269 3070 ntTSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.374e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 LAMTOR1-205ENST00000539797 535 ntTSL 512.75□□□□□ -0.374e-6■■■□□ 14.8
PCBP1Q15365 COPZ1-202ENST00000455864 880 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.444e-6■■■□□ 14.8
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