Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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