Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GAPVD1Q14C86 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
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