Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1D2Q14995 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NR1D2Q14995 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms