Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ODF1Q14990 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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