Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHD4Q14839 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD4Q14839 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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