Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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RFTN1Q14699 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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RFTN1Q14699 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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RFTN1Q14699 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFTN1Q14699 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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