Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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