Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
CDK13Q14004 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
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