Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPTAN1Q13813 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms