Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAPSNQ13702 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAPSNQ13702 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms